故事发生在一个人口老龄化的地方小城，连接着城镇与深山的堇花铁道正面临废线危机。从小就热爱这条铁路的五位少女——站长孙女椿、机械天才梅、前东京偶像堇、沉默的守车员杉以及神秘的幽灵乘客莉可——组成了“铁路保存会”。她们不仅亲自驾驶老旧的柴油机车，还开发了“宝可梦GO”式的“寻宝列车”游戏，将沿线的乡村风光与民间传说串联起来。第二季中，她们将寻找能实现愿望的“铁路精灵”传说，试图以此吸引游客。但随着调查深入，她们发现精灵的秘密与一场五十年前的雪崩事故有关，而莉可的真实身份，正是一切谜团的钥匙。
本季在延续第一季温暖治愈风格的同时，加入了奇幻悬疑元素，叙事更有层次。对铁道细节的考究一如既往，而少女们为了守护共同记忆而努力的姿态，比任何风景都动人。
天才棋手“小楠公”在夺冠后彻底失语，他那位“完美母亲”的育儿神话一夜崩塌。
十个陌生人醒来后发现自己在玩真人版“谁是卧底”，输的人真的会死。
比利时小胡子侦探回归，本季包含《百万美元债券失窃案》与《马斯顿庄园惨案》等经典谜题。
地球失去了光之巨人，一位落魄机甲驾驶员在废墟中捡到了一个自称“奥特曼幼儿”的发光体。
一个连续失眠五百天的都市白领，发现母亲的老年痴呆症让母亲也成了“不眠人”。
一名顶尖神经科学家秘密克隆了死去的妻子，却发现自己植入的妻子记忆来自另一个陌生女人的大脑。